有无种植体/种植体的数量会影响缺齿患者唾液中及舌头上的需氧菌和厌氧菌种类。

种植体周围炎患者的龈下微生物群在不同的研究中有不同的报道。牙周致病菌较部分牙缺失患者少。Prevotella nigrescens、Fusobacterium nucleatum、P. gingivalis、T. forsythia、Treponema denticola 或 Aggregatibacter actinomycetemcomitans 与种植体周围炎相关。微生物群落不同于牙周炎，消化链球菌或葡萄球菌数量

这是在功能正常的种植体的周围软组织中发生的可逆炎症过程。

在使用种植体修复的对象中，种植体周围粘膜炎的发生率接近 60%（种植体位置的 ± 30%）。

通过临床检查作出的诊断如下：受感染的种植体位置可能出现发红、水肿、增生、探诊出血和探诊敏感。排出脓液是一项有力的诊断标志。并非总是能检测到萎缩，通常不会（尚未）观察到放射性骨缺失。

引起种植体周围粘膜炎的主要原因是龈下粘接剂残留和/或不符合口腔卫生及维护规范。修复体/上层结构的设计以及是否能触及种植体周围组织以进行清洁是关键因素，可起到一定的预防和干预作用。